Pourquoi un auto-entrepreneur a besoin d’un logiciel de facturation adapté
Le statut d’auto-entrepreneur (ou micro-entrepreneur) impose des règles de facturation simplifiées mais strictes. Vous êtes en franchise de TVA tant que votre chiffre d’affaires reste sous les seuils légaux (37 500 € pour les prestations de services, 85 000 € pour les ventes de marchandises en 2026), ce qui implique la mention obligatoire « TVA non applicable, art. 293 B du CGI » sur chaque facture. Vos documents doivent aussi porter votre numéro SIRET, votre adresse, l’identité du client, la date, un numéro de facture séquentiel et — pour les prestations B2C — votre dispense d’immatriculation au RCS si vous en bénéficiez.
Au-delà de ces obligations, l’auto-entrepreneur cherche avant tout la simplicité : créer une facture en moins de deux minutes, suivre les paiements clients, déclarer son chiffre d’affaires URSSAF chaque mois ou trimestre, et garder une trace claire pour la déclaration d’impôts annuelle. Les meilleurs logiciels intègrent désormais la déclaration URSSAF en un clic et préparent automatiquement vos données pour la réforme de la facturation électronique qui s’appliquera aux micro-entreprises au 1er septembre 2027.
Critères pour bien choisir son logiciel de facturation auto-entrepreneur
- Gestion automatique de la franchise de TVA : mention « TVA non applicable, art. 293 B du CGI » insérée automatiquement, et alerte dès que vous approchez du seuil de dépassement (vous oblige à passer à la TVA en cours d’année).
- Mentions légales auto-entrepreneur : SIRET, dispense d’immatriculation, assurance professionnelle, médiateur de la consommation pour les prestations B2C — pré-remplies sur tous les documents.
- Suivi du plafond de chiffre d’affaires : tableau de bord qui affiche en temps réel votre CA cumulé et le pourcentage du plafond atteint, pour anticiper la sortie du régime.
- Déclaration URSSAF intégrée : remplissage automatique du formulaire mensuel ou trimestriel à partir de vos factures encaissées, en un clic depuis le logiciel.
- Application mobile : créer et envoyer une facture depuis votre smartphone en quelques secondes, encaisser via Stripe ou virement, recevoir une notification dès paiement.
- Statut Plateforme Agréée (PA) pour 2027 : à partir du 1er septembre 2027, les micro-entrepreneurs devront émettre leurs factures via une PA. Choisir aujourd’hui un logiciel agréé évite une migration en urgence.
- Offre gratuite ou abordable : la marge d’un auto-entrepreneur reste limitée. Plusieurs logiciels proposent une formule 100 % gratuite couvrant les besoins essentiels.
Quel logiciel choisir selon votre situation ?

Le choix dépend essentiellement de votre activité et de votre volume de facturation :
- Auto-entrepreneur qui démarre, peu de factures : Henrri (100 % gratuit, illimité) ou Abby (gratuit, conformité PA, déclaration URSSAF). C’est le point de départ idéal sans engagement financier.
- Auto-entrepreneur freelance créatif ou tech (développeur, webdesigner, photographe, rédacteur) : Indy, Freebe ou Tiime apportent une interface soignée, le suivi du temps passé, l’envoi de devis stylés et la connexion bancaire automatique.
- Auto-entrepreneur artisan ou prestation terrain (plombier, électricien, coiffeur à domicile, taxi) : Abby ou Henrri pour la simplicité mobile et la déclaration URSSAF intégrée.
- Auto-entrepreneur qui veut compte pro + facturation : Qonto combine compte bancaire professionnel et outil de facturation conforme PA, particulièrement adapté si vous démarrez votre activité.
- Auto-entrepreneur avec clients à l’international ou en B2B européen : Billit est nativement connecté au réseau Peppol, idéal pour facturer des clients belges, néerlandais, italiens ou allemands sans friction.
- Auto-entrepreneur avec activité soutenue (proche du plafond, gestion commerciale poussée) : Evoliz apporte une gestion commerciale complète (devis multi-options, relances, suivi des marges) pour anticiper le passage en société.
- Auto-entrepreneur qui anticipe un passage en EURL/SASU : Tiime permet une montée en puissance progressive sans changer d’outil le jour où vous quittez le statut de micro-entrepreneur.
Réforme 2026-2027 : ce qui change pour un auto-entrepreneur
La réforme de la facturation électronique concerne aussi les micro-entrepreneurs, même s’ils sont en franchise de TVA. Deux échéances à connaître :
- 1er septembre 2026 : obligation de réception des factures électroniques pour toutes les entreprises, y compris les auto-entrepreneurs. Concrètement, vos fournisseurs ne pourront plus vous envoyer une simple facture PDF par e-mail — la facture devra transiter par une Plateforme Agréée. Vous devez donc disposer d’un compte sur une PA pour les recevoir.
- 1er septembre 2027 : obligation d’émission des factures électroniques pour les TPE et micro-entreprises. Vos factures à destination d’autres entreprises (B2B) devront passer par une PA dans un format normé (Factur-X, UBL ou CII). Pour les clients particuliers (B2C), un e-reporting des données restera obligatoire.
Bon à savoir : la franchise de TVA ne vous exempte pas de la réforme. Même sans TVA, vous devrez transmettre vos factures via une Plateforme Agréée. Choisir aujourd’hui un logiciel déjà PA (Abby, Axonaut, Azopio, Qonto, Pennylane) vous évite une migration de dernière minute.
Questions fréquentes
Un auto-entrepreneur est-il obligé d’utiliser un logiciel de facturation ?
Aujourd’hui non, vous pouvez théoriquement éditer vos factures sur Word ou Excel. Mais à partir du 1er septembre 2027, les auto-entrepreneurs devront émettre leurs factures via une Plateforme Agréée — ce qui passe nécessairement par un logiciel compatible. Anticiper dès 2026 est fortement recommandé.
Quel logiciel de facturation gratuit pour un auto-entrepreneur ?
Henrri est 100 % gratuit sans limite de factures (conformité 2027 via Pennylane). Abby propose une offre gratuite avec déclaration URSSAF intégrée et conformité Plateforme Agréée DGFiP — probablement le meilleur compromis pour un auto-entrepreneur en 2026.
Comment mentionner la franchise de TVA sur une facture ?
La mention obligatoire est : « TVA non applicable, art. 293 B du CGI ». Elle doit apparaître clairement sur chaque facture, à la place du tableau de TVA. Tous les logiciels orientés auto-entrepreneur (Abby, Indy, Freebe, Henrri, Tiime) l’insèrent automatiquement dès que vous renseignez votre régime fiscal.
Que se passe-t-il si je dépasse le plafond de TVA en cours d’année ?
Si votre CA dépasse le seuil majoré (41 250 € pour les services, 93 500 € pour les marchandises en 2026), vous devenez redevable de la TVA à compter du premier jour du mois de dépassement. Vos factures doivent alors mentionner la TVA. Les bons logiciels (Indy, Abby, Tiime) vous alertent dès que vous approchez du plafond.
Comment déclarer son URSSAF directement depuis le logiciel ?
Plusieurs logiciels (Abby, Indy, Freebe) reprennent automatiquement le total de vos factures encaissées sur la période et pré-remplissent le formulaire URSSAF. Vous validez en un clic. Cela évite les erreurs de saisie et fait gagner 30 minutes par mois.
Faut-il mentionner le médiateur de la consommation sur une facture B2C ?
Oui, c’est obligatoire depuis 2016 pour tout professionnel ayant des clients particuliers. Vous devez indiquer le nom du médiateur agréé et ses coordonnées sur le devis, la facture ou les CGV. Les logiciels auto-entrepreneur intègrent cette mention dans le profil de l’entreprise.
Quelle différence entre auto-entrepreneur et micro-entrepreneur ?
Aucune depuis 2016 : les deux termes désignent le même régime. « Auto-entrepreneur » est le nom historique (créé en 2009), remplacé officiellement par « micro-entrepreneur » en 2016. Les obligations de facturation sont identiques.
Sélection mise à jour en juin 2026 · Statuts Plateforme Agréée vérifiés sur la liste officielle DGFiP · Avis utilisateurs analysés sur Trustpilot et Capterra.